En 1994 decide quedarse a vivir en Andalucía y adoptar el idioma castellano. Empieza a trabajar como redactor de Cultura para el diario Cádiz Información. En 1996 establece en Granada, junto a la periodista Carmen Jiménez, una agencia de información sobre el Tercer Mundo, llamada Infomundi y financiada por la ONG Medicus Mundi.
En 1997 se traslada a Madrid, donde dirige el gabinete de prensa de la ONG Save the Children España, primero, y el de Solidaridad Internacional, después. Realiza reportajes en Líbano, Uzbekistan, Marruecos y el Sáhara. En 2001 se infiltra durante un mes en un asentamiento de judíos ultrasionistas en Cisjordania.
En otoño de 2003, Topper viaja a Iraq con el cineasta Javier Corcuera para coordinar la producción del largometraje documental Invierno en Bagdad, producido por Elías Querejeta. Tras realizar reportajes en Turquía, Iraq, Siria y Líbano, trabaja de 2005 a 2008 como jefe de Internacional en la revista La Clave. En 2010 se traslada como colaborador del diario El Mundo a Estambul.
Ha publicado el poemario Años a la deriva (Quorum 2001) ganador del premio andaluz José Manuel García Gómez. Entre 2001 y 2005 escribe para el programa Océano Pacífico de Cadena Dial, conducido por María Quirós, la columna semanal 'Una gaviota en Madrid', radiada todos los lunes.
Colaboraciones de Ilya U. Topper: